声明

本文是学习GB-T 35024-2018 常见畜禽动物成分检测方法 液相芯片法. 而整理的学习笔记,分享出来希望更多人受益,如果存在侵权请及时联系我们

1 范围

本标准规定了畜禽产品中常见动物物种成分的液相芯片检测方法。

本标准适用于肉及加工品、乳、皮张、内脏、动物饲料等畜禽产品中哺乳动物和反刍动物成分,和13
种常见肉品或掺杂成分(骆驼、马、驴、牦牛、水牛、狗、猪、马鹿、羊、鸡、鸭、大鼠、小鼠)动物物种成分的定
性检测。方法的最低检出限为(质量百分比):水牛5%,哺乳、反刍、狗、羊、鸡、大鼠、小鼠为1%,骆驼、

牦牛、马鹿、猪、马、驴、鸭的最低检测限为0.1%。

2 规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文

件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法

GB/T 14699.1 饲料 采样

GB/T 27403—2008 实验室质量控制规范 食品分子生物学检测

SN/T 3561 国境口岸卫生监督食品采样、送样规程

3 术语和定义、缩略语

3.1 术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

3.1.1

液相芯片技术 suspended bead array

通过液相杂交将偶联有探针的微球与样品中靶基因序列结合,通过流式细胞技术对样品中的多种
目标成分进行同时检测。

3.1.2

液相芯片探针 suspended array probe

固定于微球表面,能与目标成分亲和结合用于探测目标成分信息的核酸或蛋白分子。

3.1.3

质控探针 quality control probe

用来监控芯片反应是否正常的探针。

注:本标准使用的是人工合成的一段寡核苷酸探针(polyT²opolyA₂o,5'端氨基标记)。

3.1.4

荧光强度中位值 median fluoresence intensity

液相芯片检测仪检测到的样品荧光信号值,即软件自动读取与样品结合的微球数量,并进行背景值

校正后得到的数值。

GB/T 35024—2018

3.1.5

阈值 cutoff value

判定阳性信号的最低荧光强度中位值。通过实验数据统计分析后得出,要求防止假阳性结果,同时

保证灵敏度需求。

3.2 缩略语

下列缩略语适用于本文件。

CTAB: 十六烷基三甲基溴化铵(cetyltrithylammonium bromide)

DNA: 脱氧核糖核酸(deoxyribonuleic acid)

dATP: 脱氧腺苷三磷酸(deoxyadenosine triphosphate)

dCTP: 脱氧胞苷三磷酸(deoxycytidine triphosphate)

dGTP: 脱氧鸟苷三磷酸(deoxyguanosine triphosphate)

dTTP: 脱氧胸苷三磷酸(deoxythymidine triphosphate)

EDC:1- 乙基- (3-二甲基氨基丙基)碳化二亚胺盐酸盐[N-
(3-dimethylaminodipropyl)-N'-ethylcar-

bodiimade]

EDTA: 乙二胺四乙酸(ethylene diaminetetraacetic acid)

MES:2- 吗啉乙磺酸[2-(N-morpholino)-ethanesulfonic acid]

SA-PE: 链霉亲和素-藻红素(streptavidin- phycoerythrobilin)

SDS: 十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate)

Taq: 水生栖热菌(Thermus aquaticu)

TE: 由 Tris 和 EDTA 配制而成的缓冲溶液(Tris-EDTA buffer solution)

TMAC: 四甲基氯化铵(tetramethyl ammonium chloride)

Tris:三(羟甲基)氨基甲烷[tris(hydroxymethyl)aminomethane]

4 方法提要

对样品中的靶基因进行 PCR 扩增,通过液相杂交将偶联探针的微球与PCR
扩增产物结合,采用流
式细胞技术对目标成分进行检测。每一种带有独特色彩编号的微球固定一种探针,特异结合一种目标
核酸序列。该核酸序列连接荧光标记物。单个的微球通过检测通道时被两束不同波长激光检测,
一束
激光检测微球的色标编码,另一束激光检测目标核酸序列荧光标记物。检测单一成分时,将该成分
PCR 产物与相应微球进行反应;检测多种成分时,可以将各个成分的 PCR
产物与微球混合物进行反

应。检测实验室需达到 GB/T 27403—2008 的要求。

5 检测用引物和探针

质控探针及检测用哺乳动物通用引物探针,反刍动物通用引物探针,以及13种特异性引物和探针

序列参见附录 A 中表 A.1。

6 试剂

6.1 Taq DNA 聚合酶。

6.2 10×PCR 缓冲液。

6.3 dNTPs(dATP、dCTP、dGTP、dTTP)。

6.4 琼脂糖。

GB/T 35024—2018

6.5 溴化乙锭。

6.6 酚 。

6.7 三氯甲烷

6.8 异丙醇。

6.9 无水乙醇。

6.10 异戊醇

6.11 分子量标准品(最小片段≥20 bp,最大片段≤2000 bp)。

6.12 TE 缓冲液(10 mmol/L Tris-HCl,pH 8.0,1 mmol/L EDTA)。

6.13 电泳缓冲液(10×TBE:Tris 54g,硼酸27.5 g,20 mL0.5 mol/L EDTA
·Tris-HCl,pH 8.0,加水 至1000 mL;50×TAE:Tris 242 g,100 mL0.5 mol/L
EDTA,pH8.0,冰乙酸,57.1 mL, 加水至1 L)。

6.14 加样缓冲液(0.25%溴酚蓝,40%蔗糖水溶液)。

6.15 非磁性微球(微球直径5.6 μm, 羧基修饰,按比例掺入660 nm 和730 nm
两种分类荧光染色,每
种荧光有10种浓度,根据比例不同可以把球型基质分类为100种)。

6.16 0.1 mol/L MES溶液。

6.17 EDC 溶液(10 mg/mL)。

6.18 0.02% Tween-20。

6.19 0. 1% SDS。

6.20 SA-PE 溶 液 。

6.21 TMAC 溶液(5 mol/L TMAC,20% N-月桂酰肌氨酸,1 mol/L Tris-HCl,pH
8.0,0.5 mol/L EDTA,pH 8.0)。

6.22 CTAB 提取液(20 g/L CTAB,1.4 mol/L NaCl,0.1 mol/L Tris-HCl,0.02
mol/L Na₂EDTA,pH 8.0)。

6.23 除另有规定外,所有试剂均为分析纯。实验用水符合GB/T 6682
中二级水的要求。

7 仪器设备

7.1 PCR 仪。

7.2 液相芯片仪。

7.3 恒温箱。

7.4 离心机:离心力15000 g。

7.5 微量移液器:0.5μL~10μL,10μL~100μL,20μL~200μL,200μL~1000μL。

7.6 核酸蛋白分析仪。

7.7 天平:感量0.01 mg。

8 样品采集与制备

8.1 样品采集与前处理

采样、送样要求应符合GB/T14699.1 和SN/T3561
的规定。按照8.1~8.2进行前处理,处理后的

样品分成三等份,包括检样、复检样和贮存样。

8.2 肉、皮张、内脏等

先依次用70%乙醇和ddH2O
冲洗2次~3次,洗去外源成分和调料等,控干水分,搅碎,收集到干

净50 mL 离心管或干净密封袋中,冻存于-20℃。

8.3 乳、饲料等

混匀后直接分装到干净50 mL
离心管或干净密封袋中,根据样品种类贮存于-20℃或4℃。

GB/T 35024—2018

9 检验步骤

9.1 DNA 提取

称取1g~2g 处理好的样品于50 mL 离心管中,加入2mL~5mLCTAB
提取液,加入20μL~ 100μL 的 2 0 mg/mL 蛋白酶 K,65℃ 温育1 h,
期间不时震荡混匀,应保证样品自由悬浮于液体中,必 要时再加入适量 CTAB
提取缓冲液。室温12000 g 离心10 min, 转移上清至2 mL 离心管中,加入等
体积的室温酚/三氯甲烷/异戊醇(25:24:1)颠倒混匀,室温12000 g
转速下离心10 min 。转移上清

液至另一灭菌的离心管中,加入等体积的三氯甲烷/异戊醇(24:1),颠倒混匀,室温下12000
g 离心

10 min;转移上清至干净离心管中;加入等体积的 CTAB 沉淀液混匀,室温沉淀1 h
。加入0.8倍体积 的异丙醇或2倍体积-20℃冰箱中预冷的无水乙醇混匀,
一20℃放置30 min~1h,12000g 4℃离心 10min,
弃上清,用70%乙醇洗涤沉淀一次,12000 g 4℃ 离心10 min,
弃上清,室温下晾干。加入 50μL~100μL 灭菌双蒸水,室温10 min, 混匀,
-20℃保存。也可用等效 DNA 提取试剂盒提取模 板 DNA。

9.2 DNA 定量

取10 μLDNA 溶液加蒸馏水稀释至1 mL,
使用核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计分别检测

260 nm和280 nm 处的吸光值。 DNA 的浓度按照式(1)计算,当OD2/OD₂
比值在1.7~2.1之间时,

适宜于 PCR 扩增。扩增前将所有样品DNA 调至约5 ng/μL~50 ng/μL。

style="width:1.98004in;height:0.58652in" /> (1)

式中:

c——DNA 浓度,单位为纳克每微升(ng/μL);

A— 260 nm 处的吸光值;

N——核酸稀释倍数。

9.3 PCR 扩增

9.3.1 PCR 体系

反应体系总体积为25μL, 其中包含:10×PCR 缓冲液2.5μL,2.5 mmol/L dNTP
2μL,单一待检 目标动物成分的上、下游引物(根据检测目标物种确定)各0.5μL
(引物浓度10 μmol/L),5 U/μL Taq

DNA 聚合酶0.2μL,5μLDNA 模板(5 ng/μL~50
ng/μL),用灭菌双蒸水补足体积至25μL。

9.3.2 PCR 参数

95℃预变性10 min;95℃ 30s,60℃30s,72℃30s,30
个循环(其中哺乳动物40个循环);72℃

延伸5 min;4 ℃保存。

9.4 液相芯片检测

9.4.1 探针与微球偶联

取出微球存储管以最高转速涡旋30 s, 超声处理15 s 。选一种微球50 μL~1.5
mL 离心管中,

10000g 离心2 min, 弃上清,用50μL0. 1mol/L
MES(pH4.5)重悬微球,彻底涡旋使微球分散成均匀

的悬浊液状态,加入一种0.5μL 预先稀释好的(0.05 nmol) 探针。制备新鲜的
EDC 溶液(10 mg/mL),

取2.5μLEDC 至微球中,彻底混匀,室温避光摇动30 min,
重复此步骤一次。加入1mL0. 1% SDS,低

速涡旋混匀,12000 g 离 心 2 min, 小心移除上清,再加入1 mL0.02%
Tween-20,低速涡旋重悬,

GB/T 35024—2018

12000g 离 心 2 min, 小心移除上清,最后用75μLTE
缓冲液重悬微球,4℃避光保存。

9.4.2 杂交反应

9.4.2.1 单微球探针

取样品的PCR 产物5μL 于45μL
的无菌水中,涡旋混匀。将单一成分微球探针涡旋重悬,与PCR

产物反应。反应体系为:微球0.5μL,PCR 产 物 1 μL,1.5×TMAC 33μL,用 1 ×TE
15.5 μL 调至

50μL, 热反应条件为:95℃ 5 min,60℃ 10 min,4 ℃保存。

9.4.2.2 多微球探针

取样品的PCR 产物5μL 于45μL
的无菌水中,涡旋混匀。将每一种微球探针均涡旋重悬,与PCR

产物反应。反应体系为:每一种微球探针0.5μL, 每一种PCR
产物1μL,1.5×TMAC33μL, 用1×TE

15.5μL 调至50μL。 热反应条件为:95℃ 5 min,60℃ 10 min,4℃保存。

9.4.3 上机检测

将杂交产物转到无菌抽滤板中,抽干,同时记录杂交体系对应孔位置。将 SA-PE
用 1 ×TE 稀释到 4 ng/μL,每孔加入50μL, 避光震荡2 min, 再室温震荡5 min。
抽干滤孔板,用125 μL TE 洗三次,用

125μL TE重悬。用矫正液矫正液相芯片仪,将上述处理好的样品上机检测。

10 质量控制

检测过程中分别设阳性对照、阴性对照、质控对照、空白对照。分别以目标引物探针对应的动物物
种的肌肉或 DNA 溶液作为阳性对照,以提取的植物组织(大豆等任一植物)或 DNA
溶液作为阴性对
照,用质控探针作检测体系的质控对照,用无菌双蒸水作空白对照。对照样品按照9.1步骤提取
DNA, 也可使用购买的DNA
溶液作为阳性或阴性对照。所有样品设3个重复,以荧光强度中位值的平均值

作为样品读数。

11 结果判定与表述

11.1 结果判定

11.1.1 质控探针荧光强度中位值大于或等于空白对照20倍。

11.1.2 阳性对照荧光强度中位值大于阈值(各成分阈值设定参见附录 A
中表 A.2)。

11.1.3 阴性对照荧光强度中位值低于阈值。

11.1.4
在满足上述结果条件下,如果样品荧光强度中位值大于或等于阈值,判定为阳性;如果低于阈
值,判定为阴性。

11.2 结果表述

11.2.1 样品检测结果阳性,表述为该样品中含有某某成分。

11.2.2 样品检测结果阴性,表述为该样品中某某成分含量低于检测线。

12 检测过程中防止交叉污染的措施

按照GB/T 27403—2008 中附录 D 的规定执行。

GB/T 35024—2018

A

(资料性附录)

常见畜禽动物成分液相芯片扩增引物探针序列及检测阈值

表 A.1
注明了本标准所使用的哺乳动物、反刍动物、骆驼、马、驴、牦牛、水牛、狗、猪、马鹿、羊、鸡、

鸭、大鼠、小鼠成分检测的引物探针序列,以及靶基因名称。表 A.2
规定了各靶标的检测信号阈值。

A.1 引物和探针序列

物种

序列(5'→3')

基因

F:Biotin-CATCCTCATGTGCTATGTCAGTA

线粒体基因

tRNA-Thr及

D-loop区

R:GCACGATGTACATAGGGTATTA

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGAGCTGATATGGTGTTGTGCGGGG

F:Biotin-CACCCTCATGTGCTATGTCAGTA

线粒体基因

tRNA-Thr及

D-loop区

R:GCACGATGTACATAGGCCATTC

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCAGGTGGGTATGGTGTTATGTGGGG

F:CAGACGGATGGGGCACCAACC

growth hormone (GH)gene

R:Biotin-GCCGCATATCTAGGAGTAGATATC

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGCTTTGGGGCTTCCGAATGTGAG

牦牛

F:GACTAATATTCGAAAATCC

cytochrome b

(cytb)gene

R:Biotin-CTCCTAGGAGGGAGCCGAAGTTTCAC

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAACGCATTCATTGACCTTCCAGCTCCAT

水牛

F:CACCATCARCACCCAAAGCTG

线粒体基因

tRNA-Pro及

D-loop区

R:Biotin-CTTGCTTATATGCATGGGGCATA

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGGAGTGGTAAGACCATATGTTGTATGC

CGTACATGCGAGG

马鹿

F:AACACGTGATATAACCTTATGCGC

D-loop region

R:Biotin- TATGTCCTATACACTAACTCATGTGC

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGCTAGAACACGCATGTATAACAGCAC

骆驼

F:AGCCTTCTCTTCAGTCGCAC

cytochrome b

(cytb)gene

R:Biotin-TGGGAGGACATAGCCCATGA

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATCTGCCGAGATGTCAATTACGGCT

F:ACACAACTTCTACCACAACCC

synthase F0

subunit 8 (ATP8)gene

R:Biotin-AAACAATGAGGGTAACGAGGG

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACACCGAAACAAAATACTCCTTGAGAAACA

F:TATTTGGAGCATGAGCCGGT

cytochrome

oxidase subunit I(COI)gene

R;Biotin-AGTAAAGTACCGGGCTGACC

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGCCTCCTCATCCGAGCCGAA

GB/T 35024—2018

A.1 (续)

物种

序列(5'→3')

基因

大鼠

F:TGCCGAGACGTAAACTACGG

cytochrome b

(cytb)gene

R:Biotin-CTCGTCCCACATGGAGGAAT

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTGATCCGATACCTACACGCCAACG

小鼠

F:TGTCGAGACGTAAATTACGG

cytochrome b

(cytb)gene

R:CTCGTCCGACATGAAGGAAT

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTAATCCGATATATACACGCAAACG

反刍

F:CACCATCARCACCCAAAGCTG

线粒体基因

tRNA-Pro及

D-loop区

R:Biotin-CTTGCTTATATGCATGGGGCATA

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTGGTCTGTGTATGGGCGTGTTATGT

TGGCTAGTGGTG

哺乳

F:CCTCAGCAGGGTCTTCACCA

growth hormone

(GH)gene

R:Biotin-TTCAGCTTCTCGTAGACNCG

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGCCTGGTGTTTGGCACCTCGGA

F:CAGGCTCAAACAACCCCCTA

cytochrome b

(cytb)gene

R:Biotin-GGGCTAGTGTTAGGAATGGGG

P:NH₂-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTACTCCTTCAAAGACATTCTGGGCT

F:CAGGCTCAAACAACCCCCTA

cytochrome b

(cytb)gene

R:Biotin-GGGCTAGTGCTATGAGGGGGG

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTCTCCTTTAAGGACATCCTAGGAT

质控

P-R:Biotin-TTTTTTTTTTTTTTTTTTT

P:NH2-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

注:P表示探针,所有探针5'端氨基化修饰,便于与羧基微球进行偶联;F表示正向引物;R表示反向引物;Biotin

表示生物素标记,便于与荧光报告分子结合。

A.2 探针检测阈值

样品

哺乳

反刍

骆驼

马鹿

水牛

牦牛

大鼠

小鼠

阈值(荧光值与

空白的倍数)

10×

20×

10×

10×

15×

50×

20×

18×

100×

20×

80×

120×

130×

80×

10×

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